Pada hari ini pada tahun 1941, penceroboh Yugoslavia Jerman dan Itali menubuhkan Negara Bebas Croatia (juga termasuk Bosnia dan Herzegovina) dan menempatkan pemimpin nasionalis Ante Pavelic, Ustase, pemberontak pro-fasis, mengendalikan apa yang tidak lebih daripada boneka Rejim paksi.

The Ustase memulakan penganiayaan yang tidak henti-henti terhadap Serbia, Yahudi, Gypsies, dan Croat antifascist. Sebanyak 350,000 hingga 450,000 mangsa dibunuh, dan kem tahanan Jasenovac akan menjadi terkenal sebagai rumah sembelih.

Serb Serbia memberikan tentangan yang sporadis, tetapi ia adalah partisan komunis, yang diketuai oleh Josip Broz Tito (seorang orang Croatia sendiri), yang menyediakan kepimpinan antifascist. Menjelang 1944, sebahagian besar Croatia'apart dari bandar-bandar utama 'dibebaskan dari angkatan Axis, dan Croats menyertai pangkat partisan dalam jumlah besar. Bagaimanapun, ketika peperangan hampir berakhir, banyak orang Croat, khususnya mereka yang terlibat dengan rejim Ustase atau yang menentang komunis, mencari status pelarian dengan Sekutu. Tetapi komandan British menyerahkan mereka kepada para partisans, yang menyembelih puluhan ribu, termasuk orang awam, pada pawai terpaksa dan kem kematian.