Konfederasi Umum Thomas "Stonewall" Jackson menangkap Harpers Ferry, Virginia (sekarang West Virginia), dan kira-kira 12,000 tentera Kesatuan sebagai tentera Jeneral Robert E. Lee bergerak ke utara ke Maryland.

Garrison Persekutuan di dalam Harpers Ferry terdedah kepada serangan Confederate selepas pencerobohan Lee ke Maryland pada bulan September. Bandar strategik di Sungai Potomac telah terputus dari seluruh tentera Kesatuan. Jeneral George B. McClellan, panglima Angkatan Tentera dari Potomac, dihantar ke Union General Dixon Miles, komandan pasukan Harpers Ferry, untuk memegang bandar itu dengan segala kos. McClellan berjanji untuk membantu, tetapi dia terpaksa berurusan dengan anggota tentera yang lain.

Jackson melancarkan artilerinya ke tempatnya dan mula membongkok bandar itu pada 14 September. Yankees tidak melepaskan peluru, dan Miles menawarkan sedikit tentangan sebelum bersetuju untuk menyerahkan diri pada pagi 15 September. Seperti bantuan Miles, Jeneral Julius White, menunggang Jackson untuk berunding dengan syarat penyerahan, satu meriam Gabungan terus menyala. Miles telah cedera parah oleh tembakan terakhir yang dipecat di Harpers Ferry.

The Yankees menyerahkan 73 kepingan artileri, 13,000 senapang, dan kira-kira 12,000 orang di Harpers Ferry. Ia merupakan satu-satunya penyerahan serang terbesar dalam perang.

Kejatuhan Harpers Ferry meyakinkan Lee untuk mengubah rancangannya. Selepas mengalami kerugian besar pada 14 September di Maryland di Pertempuran Gunung Selatan, di timur laut Harpers Ferry, Lee bercadang untuk mengumpulkan pasukannya yang tersebar dan kembali ke Virginia. Sekarang, dengan Harpers Ferry selamat, dia memanggil Jackson untuk menyertai pasukannya di sekitar Sharpsburg, Maryland. Dua hari kemudian, pada 17 September, Lee dan McClellan bertempur dengan Pertempuran Antietam.